Protein–RNA interactions for Protein: O75063

FAM20B, Glycosaminoglycan xylosylkinase, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20BO75063 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM20BO75063 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM20BO75063 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM20BO75063 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM20BO75063 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM20BO75063 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
FAM20BO75063 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM20BO75063 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM20BO75063 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms