Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EDIL3O43854 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EDIL3O43854 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EDIL3O43854 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EDIL3O43854 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
EDIL3O43854 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EDIL3O43854 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EDIL3O43854 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EDIL3O43854 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EDIL3O43854 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
EDIL3O43854 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDIL3O43854 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDIL3O43854 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDIL3O43854 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDIL3O43854 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDIL3O43854 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EDIL3O43854 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDIL3O43854 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EDIL3O43854 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms