Protein–RNA interactions for Protein: O43474

KLF4, Krueppel-like factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF4O43474 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF4O43474 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF4O43474 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF4O43474 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF4O43474 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF4O43474 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF4O43474 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF4O43474 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF4O43474 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF4O43474 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF4O43474 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF4O43474 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF4O43474 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF4O43474 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF4O43474 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF4O43474 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF4O43474 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF4O43474 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF4O43474 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF4O43474 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF4O43474 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF4O43474 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF4O43474 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLF4O43474 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLF4O43474 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLF4O43474 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLF4O43474 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLF4O43474 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLF4O43474 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLF4O43474 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLF4O43474 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLF4O43474 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF4O43474 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF4O43474 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF4O43474 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF4O43474 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF4O43474 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF4O43474 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF4O43474 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF4O43474 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF4O43474 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF4O43474 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF4O43474 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF4O43474 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF4O43474 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF4O43474 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF4O43474 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF4O43474 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF4O43474 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF4O43474 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF4O43474 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF4O43474 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF4O43474 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF4O43474 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF4O43474 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF4O43474 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF4O43474 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF4O43474 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF4O43474 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF4O43474 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF4O43474 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF4O43474 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF4O43474 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF4O43474 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF4O43474 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF4O43474 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF4O43474 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF4O43474 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF4O43474 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF4O43474 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF4O43474 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF4O43474 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLF4O43474 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLF4O43474 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLF4O43474 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLF4O43474 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLF4O43474 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLF4O43474 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLF4O43474 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLF4O43474 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLF4O43474 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLF4O43474 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLF4O43474 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLF4O43474 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF4O43474 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF4O43474 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF4O43474 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF4O43474 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF4O43474 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF4O43474 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF4O43474 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF4O43474 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF4O43474 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF4O43474 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF4O43474 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF4O43474 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF4O43474 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF4O43474 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF4O43474 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF4O43474 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms