Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SGSM2O43147 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SGSM2O43147 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SGSM2O43147 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SGSM2O43147 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SGSM2O43147 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SGSM2O43147 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SGSM2O43147 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SGSM2O43147 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SGSM2O43147 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SGSM2O43147 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SGSM2O43147 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SGSM2O43147 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SGSM2O43147 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SGSM2O43147 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SGSM2O43147 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SGSM2O43147 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SGSM2O43147 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SGSM2O43147 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SGSM2O43147 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SGSM2O43147 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SGSM2O43147 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SGSM2O43147 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SGSM2O43147 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SGSM2O43147 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SGSM2O43147 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SGSM2O43147 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SGSM2O43147 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SGSM2O43147 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SGSM2O43147 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SGSM2O43147 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SGSM2O43147 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SGSM2O43147 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SGSM2O43147 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SGSM2O43147 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SGSM2O43147 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SGSM2O43147 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms