Protein–RNA interactions for Protein: O15499

GSC2, Homeobox protein goosecoid-2, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSC2O15499 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSC2O15499 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSC2O15499 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSC2O15499 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSC2O15499 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSC2O15499 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSC2O15499 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSC2O15499 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSC2O15499 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSC2O15499 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSC2O15499 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSC2O15499 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSC2O15499 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSC2O15499 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSC2O15499 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSC2O15499 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSC2O15499 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSC2O15499 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSC2O15499 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSC2O15499 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSC2O15499 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSC2O15499 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSC2O15499 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSC2O15499 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSC2O15499 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSC2O15499 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSC2O15499 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSC2O15499 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GSC2O15499 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSC2O15499 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GSC2O15499 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GSC2O15499 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSC2O15499 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSC2O15499 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSC2O15499 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSC2O15499 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSC2O15499 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GSC2O15499 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSC2O15499 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSC2O15499 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSC2O15499 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSC2O15499 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSC2O15499 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSC2O15499 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSC2O15499 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSC2O15499 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSC2O15499 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GSC2O15499 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSC2O15499 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSC2O15499 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSC2O15499 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSC2O15499 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSC2O15499 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSC2O15499 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSC2O15499 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSC2O15499 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSC2O15499 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSC2O15499 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSC2O15499 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSC2O15499 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSC2O15499 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSC2O15499 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSC2O15499 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GSC2O15499 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSC2O15499 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSC2O15499 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSC2O15499 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSC2O15499 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSC2O15499 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSC2O15499 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSC2O15499 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSC2O15499 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSC2O15499 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSC2O15499 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSC2O15499 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSC2O15499 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GSC2O15499 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSC2O15499 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSC2O15499 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSC2O15499 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSC2O15499 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSC2O15499 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSC2O15499 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSC2O15499 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSC2O15499 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSC2O15499 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSC2O15499 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSC2O15499 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSC2O15499 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSC2O15499 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSC2O15499 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSC2O15499 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSC2O15499 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSC2O15499 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSC2O15499 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSC2O15499 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSC2O15499 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSC2O15499 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSC2O15499 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSC2O15499 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms