Protein–RNA interactions for Protein: O15013

ARHGEF10, Rho guanine nucleotide exchange factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF10O15013 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ARHGEF10O15013 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ARHGEF10O15013 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ARHGEF10O15013 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ARHGEF10O15013 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
ARHGEF10O15013 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ARHGEF10O15013 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ARHGEF10O15013 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ARHGEF10O15013 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
ARHGEF10O15013 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
ARHGEF10O15013 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ARHGEF10O15013 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ARHGEF10O15013 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ARHGEF10O15013 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ARHGEF10O15013 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ARHGEF10O15013 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ARHGEF10O15013 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ARHGEF10O15013 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ARHGEF10O15013 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ARHGEF10O15013 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ARHGEF10O15013 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ARHGEF10O15013 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ARHGEF10O15013 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ARHGEF10O15013 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ARHGEF10O15013 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ARHGEF10O15013 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ARHGEF10O15013 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ARHGEF10O15013 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ARHGEF10O15013 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ARHGEF10O15013 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ARHGEF10O15013 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARHGEF10O15013 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ARHGEF10O15013 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ARHGEF10O15013 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ARHGEF10O15013 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ARHGEF10O15013 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ARHGEF10O15013 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ARHGEF10O15013 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
ARHGEF10O15013 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ARHGEF10O15013 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ARHGEF10O15013 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ARHGEF10O15013 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ARHGEF10O15013 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ARHGEF10O15013 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ARHGEF10O15013 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ARHGEF10O15013 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ARHGEF10O15013 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ARHGEF10O15013 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ARHGEF10O15013 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ARHGEF10O15013 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ARHGEF10O15013 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ARHGEF10O15013 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ARHGEF10O15013 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ARHGEF10O15013 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ARHGEF10O15013 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ARHGEF10O15013 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ARHGEF10O15013 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ARHGEF10O15013 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ARHGEF10O15013 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
ARHGEF10O15013 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ARHGEF10O15013 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
ARHGEF10O15013 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ARHGEF10O15013 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ARHGEF10O15013 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ARHGEF10O15013 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ARHGEF10O15013 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
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