Protein–RNA interactions for Protein: O00322

UPK1A, Uroplakin-1a, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK1AO00322 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPK1AO00322 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPK1AO00322 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UPK1AO00322 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPK1AO00322 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPK1AO00322 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPK1AO00322 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPK1AO00322 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPK1AO00322 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPK1AO00322 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPK1AO00322 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPK1AO00322 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPK1AO00322 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPK1AO00322 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPK1AO00322 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPK1AO00322 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPK1AO00322 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPK1AO00322 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPK1AO00322 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UPK1AO00322 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UPK1AO00322 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPK1AO00322 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms