Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QR89 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QR89 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QR89 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QR89 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QR89 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QR89 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QR89 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QR89 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QR89 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QR89 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QR89 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QR89 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
J3QR89 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
J3QR89 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
J3QR89 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
J3QR89 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
J3QR89 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
J3QR89 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
J3QR89 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
J3QR89 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
J3QR89 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
J3QR89 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
J3QR89 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3QR89 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3QR89 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3QR89 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3QR89 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3QR89 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3QR89 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3QR89 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3QR89 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3QR89 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3QR89 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3QR89 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3QR89 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3QR89 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
J3QR89 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
J3QR89 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3QR89 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3QR89 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3QR89 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3QR89 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3QR89 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3QR89 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3QR89 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3QR89 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
J3QR89 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3QR89 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3QR89 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3QR89 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3QR89 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3QR89 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
J3QR89 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3QR89 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3QR89 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3QR89 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
J3QR89 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
J3QR89 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
J3QR89 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
J3QR89 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
J3QR89 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
J3QR89 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
J3QR89 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
J3QR89 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
J3QR89 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
J3QR89 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
J3QR89 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
J3QR89 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3QR89 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3QR89 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3QR89 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3QR89 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3QR89 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3QR89 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3QR89 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3QR89 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3QR89 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3QR89 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3QR89 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QR89 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QR89 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QR89 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QR89 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QR89 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QR89 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QR89 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QR89 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QR89 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QR89 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QR89 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QR89 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QR89 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QR89 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QR89 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QR89 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QR89 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QR89 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QR89 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QR89 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms