Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX16-NPEPL1H3BU86 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STX16-NPEPL1H3BU86 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms