Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00587B1AMM8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms