Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF1

SAC3D1, SAC3 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAC3D1A6NKF1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SAC3D1A6NKF1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAC3D1A6NKF1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAC3D1A6NKF1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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