Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC162PA2VCL2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC162PA2VCL2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC162PA2VCL2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms