Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC66A2RUB6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC66A2RUB6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC66A2RUB6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC66A2RUB6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC66A2RUB6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC66A2RUB6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC66A2RUB6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC66A2RUB6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC66A2RUB6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC66A2RUB6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC66A2RUB6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC66A2RUB6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC66A2RUB6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC66A2RUB6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC66A2RUB6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC66A2RUB6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC66A2RUB6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms