Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPDC1A2A3K4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPDC1A2A3K4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPDC1A2A3K4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPDC1A2A3K4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPDC1A2A3K4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPDC1A2A3K4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPDC1A2A3K4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPDC1A2A3K4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPDC1A2A3K4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPDC1A2A3K4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPDC1A2A3K4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPDC1A2A3K4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPDC1A2A3K4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPDC1A2A3K4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPDC1A2A3K4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPDC1A2A3K4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPDC1A2A3K4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPDC1A2A3K4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPDC1A2A3K4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPDC1A2A3K4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPDC1A2A3K4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPDC1A2A3K4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPDC1A2A3K4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPDC1A2A3K4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPDC1A2A3K4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPDC1A2A3K4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPDC1A2A3K4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPDC1A2A3K4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPDC1A2A3K4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPDC1A2A3K4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPDC1A2A3K4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPDC1A2A3K4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPDC1A2A3K4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPDC1A2A3K4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPDC1A2A3K4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPDC1A2A3K4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms