Protein–RNA interactions for Protein: A0PK05

TMEM72, Transmembrane protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM72A0PK05 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM72A0PK05 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM72A0PK05 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM72A0PK05 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM72A0PK05 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM72A0PK05 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM72A0PK05 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM72A0PK05 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM72A0PK05 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM72A0PK05 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM72A0PK05 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM72A0PK05 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM72A0PK05 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM72A0PK05 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM72A0PK05 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM72A0PK05 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM72A0PK05 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM72A0PK05 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM72A0PK05 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM72A0PK05 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM72A0PK05 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM72A0PK05 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM72A0PK05 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM72A0PK05 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM72A0PK05 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMEM72A0PK05 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.1 ms