Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A0U1RRA0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A0A0U1RRA0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms