Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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ARL2-SNX15V9GYD0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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ARL2-SNX15V9GYD0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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ARL2-SNX15V9GYD0 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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ARL2-SNX15V9GYD0 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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ARL2-SNX15V9GYD0 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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ARL2-SNX15V9GYD0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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ARL2-SNX15V9GYD0 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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