Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC4Q9Y296 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms