Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK1Q9UPV9 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms