Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF8Q9UPP1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms