Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PADI1Q9ULC6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PADI1Q9ULC6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms