Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT172Q9UG01 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms