Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms