Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL9Q9P2J3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL9Q9P2J3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL9Q9P2J3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL9Q9P2J3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL9Q9P2J3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL9Q9P2J3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL9Q9P2J3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL9Q9P2J3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL9Q9P2J3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL9Q9P2J3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL9Q9P2J3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL9Q9P2J3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL9Q9P2J3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL9Q9P2J3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL9Q9P2J3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL9Q9P2J3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL9Q9P2J3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL9Q9P2J3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL9Q9P2J3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL9Q9P2J3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL9Q9P2J3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL9Q9P2J3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL9Q9P2J3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL9Q9P2J3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL9Q9P2J3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL9Q9P2J3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL9Q9P2J3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms