Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
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