Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYP4F12Q9HCS2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms