Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms