Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms