Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms