Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBC1D3P4-201ENST00000338790 1075 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL117339.1-201ENST00000419779 428 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD20A11P-205ENST00000442192 920 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC109597.1-201ENST00000564016 786 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms