Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms