Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms