Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERPUD2Q9BSE4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms