Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms