Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL15Q96M94 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms