Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms