Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PGAM5Q96HS1 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PGAM5Q96HS1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PGAM5Q96HS1 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PGAM5Q96HS1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PGAM5Q96HS1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PGAM5Q96HS1 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PGAM5Q96HS1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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