Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms