Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSPRY1Q96DX4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RSPRY1Q96DX4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSPRY1Q96DX4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSPRY1Q96DX4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSPRY1Q96DX4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms