Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms