Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRSK1Q8TDC3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BRSK1Q8TDC3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms