Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC112Q8NEF3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms