Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC21AQ8NDW8 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms