Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms