Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4T4

ARHGEF39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, humanhuman

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF39Q8N4T4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGEF39Q8N4T4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARHGEF39Q8N4T4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARHGEF39Q8N4T4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARHGEF39Q8N4T4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARHGEF39Q8N4T4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARHGEF39Q8N4T4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARHGEF39Q8N4T4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARHGEF39Q8N4T4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARHGEF39Q8N4T4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARHGEF39Q8N4T4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGEF39Q8N4T4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGEF39Q8N4T4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGEF39Q8N4T4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGEF39Q8N4T4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGEF39Q8N4T4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGEF39Q8N4T4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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