Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1N4

KRT78, Keratin, type II cytoskeletal 78, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT78Q8N1N4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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KRT78Q8N1N4 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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KRT78Q8N1N4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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KRT78Q8N1N4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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