Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTROBQ8N137 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms