Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC27A4Q6P1M0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms