Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms