Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT80Q6KB66 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms